Facendo una ricerca approfondita su internet, ho trovato che vi sono più sistemi gratuiti per fare il tracciamento dei click AdSense ma sono tutti di dubbia affidabilità.
Un mio consiglio è quello di provarli e vedere come vanno.

Il primo sistema sfrutta gli obiettivi di google analyst tramite l'inserimento di un codice javascript nel tuo sito:
http://www.seobook.com/archives/001370.shtml

Un sistema simile, però utilizzando coldfusion:
http://blog.merlinox.com/tracciare-i...ropri-adsense/

Infine si dice che inserendo il widget di MyBlogLog è possibile tracciare anche i click sui banner del proprio sito tramite le sue statistiche, ma c'è qualche rischio:
http://www.italiasw.com/mybloglog-il...lo-o-bannarlo/